人类进化历程中的近期自然选择：如何从分子遗传学中找证据-VG图的模式识别
VG图的模式识别
freesurfer分析3D数据中文教程
freesurfer是一个处理大脑3D结构像数据，进行自动皮层和皮下核团分割的工具，用起来非常方便。freesurfer wiki上的教程也非常详细，但是有一点，freesurfer的命令很复杂，很难准确地记住每个参数该怎么设置。本人比较懒，不愿记，也记不住，每次都需要打开wiki进行对照。由于wiki非常详尽，每次都是在一大篇英文中搜索命令。在这里弄一个简洁版，只把分析流程所用到的命令贴在这里，以便查阅。
Spss 18版本前的Friedman检验 Post-hoc comparisons spss syntax代码
刚从同学那里了解到spss.18之前的版本不能自动进行单因素多水平重复测量的Friedman检验，需要用spss syntax代码实现。而spss.18后就可以自己算了。在网上找到一段代码，并且也没有介绍怎么运行，可能对spss syntax代码不了解的同学用起来还是有些不便。自己琢磨了一下，所以在这里给大家一起分享了。
fslorient和fslswapdim命令对3D图像进行方向转换(neurological to radiological)
前面提到从scan中下来的数据需要用dcm2nii或者MNIConvert把原始的dcm数据转化为NifTI的hdr/img或者nii格式。再用dcm2nii转化的时候有一个选项orient，可以自动对3D数据进行方向的转换，转到与标准空间最相似的方向。在脑成像数据处理，图像的方向是非常重要的，同时也是很容易弄错的。数据处理时，一定要对数据的方向有很清楚的认识。目前常提到的方向有Neurological和Radiological两种方向。
shell的sed命令详解和sed命令举例
在fsl和freesurfer的脑成像数据处理中，常常会用到sed命令，包括字符替换功能，提取文件内容等。比如说处理功能像数据的时候，经常在Feat中用一个被试的数据生成一个design.fsf，然后替换被试名字，生成所有被试的design_sub***.fsf文件，然后用for循环提交所有命令。有时候，又需要一行一行的读取某一个文件。所以sed非常实用，功能强大，但是也非常复杂，要完全掌握很难，一些常用的实用功能有必要了解，对于数据处理有很大的帮助。
fsl和freesurfer中常用的shell命令举例
在用 fsl和freesurfer处理数据的时候，除了需要看log文件是否有报错外，还常常需要check一下output文件数目是否对，复制数据和文件夹，文件和文件夹重命名等，并把这些结果输出到文本文件中。